因废水来源、水质、水量等不同，高氨氮废水处理有多种工艺。归纳分析后，高氨氮废水处理的主要工艺流程是：高氨氮废水预处理----脱氨氮----后处理。
预处理过程的目的是为了将高氨氮废水的pH值、温度、浓度、浊度、抑制组分浓度等，调节至适宜条件，以利于脱氨氮过程进行。预处理过程通常有：加酸/碱调节料液pH、料液升温/降温、絮凝、沉淀、过滤（砂滤、保安过滤、微滤、超滤等）、调节抑制组分组分浓度（除油、脱硬、去除重金属离子、降低盐浓度、投加营养元素等，及其它影响氨氮脱除过程操作的化学物质），从而为脱氨氮过程提供了良好原料及操作条件。
脱氨氮过程是采用一种废水脱氨技术、或几种废水脱氨技术联合将氨氮脱除至达标，得到无氨或低氨料液；将废水中氨氮转化为氮气排入空气中，或者以氨形式分离/脱出，或者转化为铵盐，脱氨技术及操作条件不同，所得到的副产物不同。脱氨氮的技术有：吹脱、汽提（蒸馏、精馏）、生化（包括生物硝化反硝化、膜生物反应器、同步硝化反硝化、短程硝化反硝化、厌氧氨氧化等）、折点氯化、 磷酸铵镁沉淀、气态膜、沸石、离子交换、电渗析、反渗透、纳滤等。
       后处理过程，一方面是对低氨或无氨废水，回用、直接排放、或者进入下一级处理工艺；另一方面是对脱氨副产物（氮气、氨或铵盐），氮气排放、氨或铵盐再利用或销售做进一步处理/加工。后处理过程因目的导向不同，而有多种技术。